Nghi ngờ về cái chết của bin Laden bởi việc quân đội Mỹ cho rằng việc xử lý thi thể của ông ta trên biển, quyết định không công bố bất kỳ bằng chứng hình ảnh hoặc DNA nào về cái chết của bin Laden cho công chúng xác nhận, các mâu thuẫn về vụ việc ( với câu chuyện chính thức về cuộc đột kích dường như thay đổi hoặc trực tiếp mâu thuẫn với các xác nhận trước đó), và cú mất điện 25 phút trong cuộc đột kích vào khu nhà của bin Laden, và nguồn cấp dữ liệu trực tiếp từ các camera gắn trên mũ của lực lượng đặc biệt Hoa Kỳ cũng bị ngắt quãng.
Vào ngày 1 tháng 5 năm 2011, một hình ảnh cho thấy Bin Laden đã chết được phát trên truyền hình Pakistan. Mặc dù câu chuyện đã được nhiều báo chí Anh, cũng như Associated Press đón nhận, nó đã nhanh chóng bị xóa khỏi các trang web sau khi bị phơi bày là giả mạo.
Vào ngày 4 tháng 5, chính quyền Obama tuyên bố sẽ không công bố bất kỳ hình ảnh nào về xác chết của Bin Laden. Chính quyền đã xem xét phát hành các bức ảnh để xua tan những tin đồn về trò lừa bịp, có nguy cơ có thể khiến al Qaeda phát động trả thù. Một số hình ảnh về hậu quả của cuộc đột kích đã được đưa cho Reuters bởi một quan chức an ninh Pakistan ẩn danh, nhưng mặc dù tất cả đều có vẻ xác thực, chúng được chụp sau khi lực lượng Hoa Kỳ rời đi và không ai trong số họ đưa ra bằng chứng liên quan đến số phận của bin Laden.
Vào ngày 6 tháng 5, có thông tin rằng một trang web của al-Qaeda đã thừa nhận cái chết của bin Laden. Vào ngày 11 tháng 5, thượng nghị sĩ đảng Cộng hòa và thành viên Ủy ban Vũ trang Thượng viện Jim Inhofe tuyên bố ông đã xem những bức ảnh "khủng khiếp" về xác chết của Bin Laden, và sau đó xác nhận rằng thi thể "chính là Bin la Den".
Vào ngày 21 tháng 5 năm 2015, nhà báo Seymour Hersh đã công bố một báo cáo tuyên bố rằng Pakistan đã giữ bin Laden bị quản thúc tại gia từ năm 2006, rằng Hoa Kỳ đã biết về vị trí của bin Laden thông qua một quan chức tình báo Pakistan (tức là không phải thông qua theo dõi chuyển phát nhanh mà Mỹ đưa ra lúc trước), Nhà Trắng từ chối bình luận về báo cáo của Hersh.
Nguồn gốc của sự hoài nghi về câu chuyện của chính phủ Hoa Kỳ là từ chối cung cấp bất kỳ bằng chứng vật lý nào để chứng minh cho tuyên bố của mình. Mặc dù cuộc đột kích Abbottabad đã được các quan chức Mỹ mô tả rất chi tiết, nhưng không có bằng chứng vật lý nào chứng minh cái chết thực sự của Bin La Den cho công chúng xác nhận, cho các nhà báo cũng như các bên thứ ba độc lập, những tổ chức yêu cầu thông tin này thông qua Đạo luật Tự do Thông tin. Nhiều tổ chức đã đệ trình yêu cầu của FOIA để tìm kiếm ít nhất một bản phát hành hình ảnh, video và / hoặc kết quả xét nghiệm DNA, bao gồm Associated Press, Reuters, CBS News, Judicial Watch, Politico, Fox News, Citizens United và NPR. Tại thời điểm nộp yêu cầu FOIA của họ, Associated Press cho biết: "Thông tin này rất quan trọng đối với hồ sơ lịch sử. Đó là quan điểm của chúng tôi." Michael Oreskes, Biên tập viên quản lý cấp cao, Associated Press nói.
Vào ngày 26 tháng 4 năm 2012, một thẩm phán liên bang Hoa Kỳ đã quyết định trong vụ án Watch Justice, Bộ Quốc phòng Hoa Kỳ rằng DoD không cần phải tiết lộ bất kỳ bằng chứng nào cho công chúng. Nghi ngờ về cái chết của bin Laden được thúc đẩy bởi việc quân đội Hoa Kỳ xử lý thi thể của ông ta trên biển, mặc dù các quan chức Hoa Kỳ cho rằng việc chôn cất là cần thiết bởi vì "không có bất kỳ quốc gia nào chịu chôn cất Bin Laden trong vòng 24 giờ, theo truyền thống của đạo Hồi".
Nhưng lạ ở chỗ, việc thực hiện truyền thống Hồi giáo không phải lúc nào cũng được Hoa Kỳ tuân thủ trong quá khứ. Ví dụ, thi thể của Uday Hussein và Qusay Hussein, con trai của Saddam Hussein, đã bị giữ trong 11 ngày trước khi được mang đi chôn cất.
Quyết định rải tro cốt bin Laden trên biển đã bị những kẻ khủng bố và cả những người sống sót 9/11, người thân của các nạn nhân nghi ngờ. Giáo sư Peter Romaniuk của Đại học John Jay đã mô tả việc rải tro cốt xuống biển như một cách để tiếp tục đặt câu hỏi. Ông tuyên bố: "Rõ ràng là họ chịu áp lực phải đưa ra bằng chứng và đây là một cách để đưa vấn đề đó ra khỏi bàn." Một lợi thế rõ ràng của việc rải tro cốt xuống biển là không dễ dàng được xác định vị trí, do đó ngăn vị trí trở thành tâm điểm chú ý hoặc "đền thờ khủng bố".
Các quan chức cấp cao của Pakistan phổ biến lý thuyết rằng không có vụ tấn công nào xảy ra, và không có bất cứ ai bị lực lượng Hoa Kỳ bắt giữ, họ đã xử tử Bin La Den bên ngoài khu nhà và đưa xác ông ta đi trên một chiếc trực thăng.
Hamid Gul, cựu giám đốc Cơ quan Tình báo Liên bang (ISI) của Pakistan, đã tuyên bố trong một cuộc phỏng vấn với CNN rằng ông tin rằng bin Laden đã chết nhiều năm trước, và câu chuyện về cái chết chính thức được truyền thông Mỹ đưa ra là một trò lừa bịp. Hơn nữa, Hamid Gul nghĩ rằng chính phủ Mỹ đã biết về cái chết của bin Laden trong nhiều năm, "Họ phải biết rằng Bin La Den đã chết cách đấy vài năm. Họ đã giữ kín câu chuyện này và họ đã tìm kiếm một khoảnh khắc thích hợp để tuyên bố. Và lúc đó là một thời điểm tốt, bởi vì Tổng thống Obama đối đầu cuộc bầu cử cuối năm 2012 khi ông tái tranh cử tổng thống. Tôi nghĩ rằng lúc đó 1-5-2011 là thời điểm rất thích hợp để họ lôi ra.
Bashir Qureshi, người sống gần khu nhà nơi bin Laden bị bắn và nơi mà các cửa sổ bị thổi bay trong cuộc đột kích nói: "Không ai tin điều đó. Chúng tôi chưa bao giờ thấy bất kỳ người Ả Rập nào quanh đây, ông ta (Bin La Den) đã không ở đây."
Một số người Iran nói rằng họ tin rằng Bin Laden đã làm việc với Hoa Kỳ trong toàn bộ cuộc chiến chống khủng bố. Ismail Kosari, một nghị sĩ Iran, nói rằng bin Laden "chỉ là một con rối do chế độ Zionist kiểm soát nhằm đưa ra một hình ảnh bạo lực về Hồi giáo sau vụ tấn công ngày 11 tháng 9", và cái chết của ông ta "là sự qua đời một con tốt của Mỹ và tượng trưng cho sự kết thúc của một thời đại và sự khởi đầu của một thời đại khác của Mỹ trong khu vực ".
Một nghị sĩ khác, Javad Jahangirzadeh, nói rằng ông tin rằng chính Hoa Kỳ đã thực hiện các cuộc tấn công khủng bố và bin Laden là người trợ giúp chính. Ông tuyên bố: "Phương Tây rất hài lòng với các hoạt động của bin Laden. Phương Tây buộc phải giết ông ta để ngăn chặn sự rò rỉ thông tin có thể, thông tin quý hơn vàng mà." Cựu Tổng thống Iran Mahmoud Ahmadinejad nói "Tôi có thông tin chính xác rằng bin Laden đã bị quân đội Mỹ giam giữ trong một thời gian ... cho đến ngày họ giết ông ta, ông ta là tù nhân của họ", trong một cuộc phỏng vấn trực tiếp trên truyền hình nhà nước Iran.
Berkan Yashar, một chính trị gia Thổ Nhĩ Kỳ, tuyên bố rằng bin Laden đã chết vì nguyên nhân tự nhiên vào ngày 26 tháng 6 năm 2006 và đã được chôn cất. Người Mỹ đã đào xác Bin Laden và trưng bày nó, nói dối với thế giới rằng ông ta đã bị giết trong một vụ tấn công.
Vào ngày 21 tháng 5 năm 2015, nhà báo đoạt giải Pulitzer Seymour Hersh đã xuất bản một cuốn sách (The Killing of Osama bin Laden). Seymour Hersh cho rằng Cơ quan Tình báo Dịch vụ Liên bang Pakistan (ISI) đã giữ bin Laden quản thúc tại Abbottabad từ năm 2006, và khi Hoa Kỳ phát hiện ra, người đứng đầu Quân đội Pakistan Pervez Kayani và Giám đốc ISI Ahmad Shuja Pasha đã giúp Hoa Kỳ trong việc giết Bin Laden. Các nguồn tin tình báo Hoa Kỳ và Pakistan tuyên bố rằng Hoa Kỳ đã biết về vị trí của bin Laden thông qua một "walk-in, nhưng Hersh lại cho rằng một cựu sĩ quan ISI đã đến Đại sứ quán Hoa Kỳ tại Islamabad năm 2010 để kiếm phần thưởng 25 triệu đô la, chứ không phải thông qua theo dõi một người chuyển phát nhanh. Được đăng tải sau đó bởi NBC nhưng Nhà Trắng từ chối bình luận.
Nhà báo Pakistan Ahmed Rashid trong Tạp chí New York thấy sự hợp tác giữa CIA và ISI mà Hersh mô tả là "không thể tưởng tượng được", một phần vì năm 2011 là "năm tồi tệ nhất trong quan hệ Mỹ-Pakistan kể từ cuối những năm 1980" và "hận thù và nghi ngờ " giữa CIA và ISI là" đỉnh điểm", Hershs đã không đề cập đến trong cuốn sách của mình. Tính khả thi của lý thuyết Hersh, theo Rashid, là sự không hợp lý rằng Hoa Kỳ "bình tĩnh chấp nhận" việc ẩn náu / bảo vệ bin Laden của Pakistan.
Andrew Anthony The Guardian gọi các lý thuyết của Hersh là "mạnh mẽ nhưng không thuyết phục". Nhà hoạt động chống chiến tranh Cindy Sheehan tuyên bố "Nếu bạn tin Laden đã bị chết trong vụ SEAL Abbottabad, bạn thật ngu ngốc ". Sheehan tuyên bố thêm: "Bằng chứng duy nhất về việc bin Laden đã chết là DNA, nhưng DNA đâu? "
Trên Russia Today, người dẫn chương trình phát thanh Alex Jones tuyên bố rằng bin Laden đã chết gần mười năm trước (2002) và cơ thể ông đã được giữ trong nitơ lỏng để có thể được sử dụng như một công cụ tuyên truyền vào thời điểm chính trị trong tương lai. Năm 2002, ông tuyên bố rằng một nguồn tin Nhà Trắng ẩn danh đã nói với ông rằng bin Laden "bị đóng băng, đóng băng theo nghĩa đen và ông sẽ được tung ra trong tương lai vào một ngày nào đó".
Trong một cuộc phỏng vấn riêng vào năm 2002, Steve Pieczenik nói với Jones rằng bin Laden đã chết trong nhiều tháng. Jones cũng chỉ ra những bình luận tương tự được đưa ra bởi cựu Ngoại trưởng Madeleine Albright năm 2003, "Vâng, chúng tôi đã được thông báo rằng họ đã có xác ông ta". Mạng lưới truyền hình Iran Press TV đã phỏng vấn Tarpley và Stephen Lendman, cả hai đều nghi ngờ câu chuyện chính thức về cái chết của bin Laden. Tarpley cho biết ông tin rằng bin Laden đã chết từ lâu. Ông cũng tuyên bố rằng công chúng đã bị lừa dối bởi một bộ phim do Mỹ dàn dựng. Cả Tarpley và Lendman đều cho rằng thông báo của Obama cũng là một cái cớ để lôi kéo Hoa Kỳ tham gia các cuộc chiến tranh với Pakistan và các quốc gia Trung Đông.
Andrew Napolitano, người dẫn chương trình Freedom Watch của Fox Business, nói rằng cái chết của bin Laden không thể được xác minh và ám chỉ rằng Obama đã sử dụng cái chết của bin Laden để cứu nhiệm kỳ "tổng thống tệ hại" của mình.
Nghị sĩ Canada, Thomas Mulcair, đã tuyên bố trong một cuộc phỏng vấn với Đài truyền hình CBC rằng "Tôi không nghĩ từ những gì tôi nghe được rằng những hình ảnh đó [về cơ thể của bin Laden] tồn tại". Nhận xét của ông đã bị hàng chục cơ quan truyền thông Hoa Kỳ và nhiều chính trị gia Canada chỉ trích.
Một tuyên bố chính thức từ Taliban tuyên bố rằng việc thiếu ảnh bằng chứng hoặc đoạn phim video là đáng ngờ, vì các nguồn tin thân cận với Bin Laden đã không xác nhận hoặc phủ nhận cái chết của Bin La Den, và rằng trong "khi người Mỹ giết chết Mullah Dadullah (chỉ huy quân sự của Taliban) thì họ lại công khai các cảnh quay ". Và rằng thông báo về cái chết của bin Laden đã kịp thời "bịt miệng" chương trình Ngôi sao tập sự "Celebrity Apprentice"nổi tiếng của Donald Trump vì dám đặt câu hỏi công khai về tính xác thực của giấy khai sinh của Barack Obama (không phải sinh ở Mỹ).
